就在李贤被废的第二天，武则天便下旨立她的第三皇子英王李哲（李显）为太子。
公众对于李贤的被废，疑虑重重。为了掩人口目，武后下令在洛阳公开烧掉太子宫中发现的盔甲，以便让百姓和官员们看到太子的罪证。
李贤的倒台，使许多有名望的人物受到株连。宰相张大安，被谪流放四川。两位王子李炜与李明被流放到很远的西南地区。另外几位曾是李贤老师的大臣，虽然后来都被赦免并官复原职，但对他们的指控均大大损害了他们的权力。
开耀元年（681年）十一月，武则天又将他迁往距京城2300里之遥的巴州（今四川巴中）。
再两年多以后，文明元年三月（684年），在庇护李贤的唐高宗驾崩以后，李贤终于被武则天派遣的酷吏左金吾将军丘神勣逼令自杀。
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